La ANCAQ es el organismo responsable de la implementación de la Convención de Armas Químicas en el territorio de la República Argentina
Esta Convención prevé la prohibición del desarrollo, producción, almacenamiento y empleo de armas químicas y la destrucción de los arsenales existentes. Para ello, establece un sistema de control basado en declaraciones e inspecciones obligatorias sobre sustancias e instalaciones que pueden tener un uso dual.
La Autoridad Nacional fue establecida en 1997 como una Comisión Interministerial, compuesta por un Directorio integrado por el Ministerio de Defensa, el Ministerio de Producción y el Ministerio de Relaciones Exteriores y Culto, y una Secretaría Ejecutiva, que tiene su sede en este último Ministerio.